微波具有熱效應(yīng)和非熱效應(yīng)雙重殺菌的作用。微波熱效應(yīng)殺菌機(jī)理是指：生物細(xì)胞是由水、蛋白質(zhì)、核酸，碳水化合物，脂肪和列機(jī)物等復(fù)雜化合物構(gòu)成的一種凝聚態(tài)介質(zhì)。該介質(zhì)在強(qiáng)微波場(chǎng)的作用下，溫度升高。其空間結(jié)構(gòu)發(fā)生變化或破壞，蛋白質(zhì)變性，影響其溶解度、粘度、膨脹性、穩(wěn)定性，從而失去生物活性。簡(jiǎn)單地說微波殺菌、保鮮是微波熱效應(yīng)和非熱效應(yīng)共同作用的結(jié)果。微波殺菌設(shè)備的熱效應(yīng)主要起快速升溫殺菌作用；而非熱效應(yīng)則使用微生物體內(nèi)蛋白質(zhì)和生理活性物質(zhì)發(fā)生變異，而喪失活力或死亡。

以下是微波殺菌設(shè)備進(jìn)行殺菌的特點(diǎn)： 

１、時(shí)間短、速度快：常規(guī)熱力殺菌是通過熱傳導(dǎo)、對(duì)流或輻射等方式將熱量從食品表面?zhèn)髦羶?nèi)部，往往需要較長的時(shí)間，內(nèi)部才能達(dá)到殺菌溫度。微波則利用其穿透射作用，以熱效應(yīng)和非熱效應(yīng)的共同作用，使物品內(nèi)外均勻的、迅速升溫殺滅細(xì)菌。處理時(shí)間大大縮短，在強(qiáng)功率密度強(qiáng)度下，甚至只要幾秒～數(shù)十秒即達(dá)到滿意效果。 

２、低溫殺菌、保持其營養(yǎng)成份：微波熱效應(yīng)的快速升溫和非熱效應(yīng)的生化作用，增強(qiáng)了殺菌功能。相比常規(guī)熱力殺菌在比較低溫的溫度、較短的時(shí)間內(nèi)就能獲得殺菌滅蟲的效果，一般殺菌溫度在75～80℃，處理時(shí)間3～5分鐘。微波特有加工方式能保留更多的有效成分。保持原有的色、香、味、形等風(fēng)味。如采用常規(guī)熱力處理蔬菜保留的維生素C在46～50％，微波處理能達(dá)到60～90％；常規(guī)加熱豬肝維生素A保持在58％，而微波加熱則達(dá)84％。 3、節(jié)能高效：微波熱效率高，一般在80％以上，遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于其它加熱方式。加之，微波是直接對(duì)食品（物體）進(jìn)行磁熱能量轉(zhuǎn)換，微波加熱器本身不會(huì)被加熱，因而不存在額外的熱功耗，所以節(jié)能省電，相比節(jié)能30～50％。 

４、殺菌均勻徹底：常規(guī)熱力殺菌是從物料表面開始的，通過熱傳導(dǎo)，由表及里漸次加熱，內(nèi)外存在溫差梯度，造成內(nèi)外殺菌效果不一致，愈厚問題就愈突出。為保持食品風(fēng)味，縮短工業(yè)微波知識(shí)普及系列之微波保鮮處理時(shí)間，就得提高處理溫度換取處理時(shí)間的縮短，然而這將使食品表面的色、香、味、形等品質(zhì)下降。而微波的穿透性，使表面與內(nèi)部同時(shí)受熱，保證內(nèi)外均勻殺菌。 

５、易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化流水線生產(chǎn)：微波設(shè)備操作簡(jiǎn)便，沒有熱慣性，能根據(jù)生產(chǎn)工藝要求實(shí)時(shí)調(diào)控。整條生產(chǎn)線只需1～2名操作工。 

６、工藝先進(jìn)：微波殺菌設(shè)備不需要鍋爐、復(fù)雜的管道系統(tǒng)、煤場(chǎng)和運(yùn)輸車輛等，只需水、電基本條件即可，對(duì)廠房無特殊要求。投資少、見效快。 

７、微波殺菌設(shè)備緊湊節(jié)省占地面積：微波設(shè)備無高溫余熱，不產(chǎn)生熱輻射，能改善工作環(huán)境；而且設(shè)備結(jié)構(gòu)緊湊、節(jié)省廠房面積。